应针对病原体治疗，如条件不允许，用广谱抗生素治疗。本病治疗时所需的疗程较长。
　　(一)治疗
　　1、目前对四环素、强力霉素、红霉素已有不少菌株产生耐药。新一代合成抗菌药喹诺酮类，不但对衣原体、支原体有效，对淋球菌也高度敏感。
　　(1)氟哌酸200mg，3/d 共用14d。
　　(2)氟嗪酸200mg，2/d共用14d.
　　(3)环丙氟哌酸250mg，2/d，共用14d。
　　2、磺胺、利福平对衣原体有效，对支原体无效。
　　3、庆大霉素、新霉素、多粘菌素对衣原体无效。
　　4、链霉素、壮观霉素对衣原体无效，对支原体有效。
　　5、四环素0.5g，4/d，共用7d，改0.25g，4/d，共用14d。
　　6、强力霉素0.1g，2/d，共用7d。
　　7、红霉素硬脂酸盐0.5g，4/d，共有7d。
　　8、红霉素琥珀酸乙酯0.8g，4/d，共用7d。
　　9、美满霉素0.2g即刻，0.1g，2/d，共用14d。
　　(二)判断治愈标准
　　治疗结束一周应随访复查。治愈标准：1、临床症状消失1周以上，尿道无分泌物，或分泌物中白红胞≤4个/100倍显微镜。
　　2、尿液澄清，沉渣镜检阴性。
　　3、尿道(宫颈)标本衣原体、支原体检查阴性(有条件时)。