区分卵巢肿瘤属于良性或恶性，是诊断和治疗该类肿瘤的重要环节。不要把恶性肿瘤当成良性肿瘤，以免贻误时机，造成不可挽回的后果。但如将良性肿瘤当成恶性肿瘤治疗，会给病人带来沉重的精神负担，遭受不必要的痛苦。因此，希望在治疗前就能将良、恶性区别开来，虽然有时有一定的困难，但以下几点可供鉴别：
(1)病史方面：良性卵巢肿瘤患者病程长，肿瘤逐渐长大，多无症状；而恶性者病程短，肿瘤迅速增大，且有时伴发热。
(2)一般情况：良性卵巢肿瘤患者全身情况好，多发生于生育期妇女；而恶性者因病情发展快，早期即有转移病灶，能迅速出现恶病质，发病多见于幼女、青少女或绝经后妇女。
(3)体征：良性卵巢肿瘤常为单侧，可活动，囊性，表面光滑，包膜完整，不伴腹水；而恶性肿瘤多为双侧，不活动，与周围组织常有粘连，实性或部分实性，表面常有赘生物，可能穿破包膜，种植于腹腔或盆腔内，在子宫直肠陷凹处可触到固定结节，常有血性腹水，于抽吸的腹水中可能查到癌细胞。
(4)病理检查：最重要的鉴别方法是取病灶活组织作病理检查，或将手术取下的肿瘤作全面的病理检查，观查肿瘤组织的结构，瘤细胞的形态、分化程度、核染色及核分裂等，是确定良、恶性卵巢肿瘤的重要依据。