自然流产主要症状为停经后出现阴道流血和腹痛。孕12周前发生的流产，开始時绒毛与蜕膜剥离，血窦开放，出现阴道流血；玻璃的胚胎及血液刺激子宫收缩，排除胚胎，产生阵发性下腹部疼痛。当胚胎完全排出后，子宫收缩，血窦闭合，出血停止，所以早期自然流产的全过程为先出现阴道流血，而后出现腹痛。晚期流产的临床过程与早产及足月产相似，胎盘及胎儿娩出后，通常出血不多，所以，晚期流产的全过程为先出现腹痛（阵发性缩），后出现阴道流血。

自然流产时检查子宫大小、宫颈口是否扩张及是否破膜，根据妊娠周数及流产过程不同而异。